Pagubugan adalah sebuah desa di Kecamatan Binangun, Kabupaten Cilacap, Provinsi Jawa Tengah, Indonesia.Terdiri dari 20 RT, 6 RW dan 2 Dusun : Dusun Paladadi, Dusun Purwadadi. Sebagian besar masyarakatnya bermata pencaharian sebagai petani, nelayan,dan Penderes nira kelapa.
